背景:前列腺癌(PCa)是男性泌尿系統(tǒng)常見(jiàn)的惡性腫瘤。Cuproposis作為一種新型調(diào)節(jié)性細(xì)胞死亡,在PCa中仍不清楚。本研究旨在探討銅下垂相關(guān)基因(CRGs)在PCa分子分層、預(yù)后預(yù)測(cè)和臨床決策中的作用。
方法:通過(guò)聚類分析鑒定Cuproposis相關(guān)分子亞型。通過(guò) LASSO cox 回歸分析構(gòu)建預(yù)后特征,并進(jìn)行 10 倍交叉驗(yàn)證。它在內(nèi)部驗(yàn)證隊(duì)列和八個(gè)外部驗(yàn)證隊(duì)列中得到了進(jìn)一步驗(yàn)證。使用ssGSEA和ESTIMATE算法比較了兩個(gè)風(fēng)險(xiǎn)組之間的腫瘤微環(huán)境。利用qRT-PCR在細(xì)胞水平上探索這些模型基因的表達(dá)和調(diào)控。此外,使用4D無(wú)標(biāo)記LC-MS/MS和RNAseq研究關(guān)鍵模型基因B4GALNT4敲低后CRG在蛋白質(zhì)和RNA水平上的變化。
結(jié)果:鑒定出兩種與Cuproposis相關(guān)的分子亞型,在預(yù)后、臨床特征和免疫微環(huán)境方面存在差異。免疫抑制微環(huán)境與預(yù)后不良有關(guān)。構(gòu)建了由五個(gè)基因(B4GALNT4、FAM83D、COL1A、CHRM3和MYBPC1)組成的預(yù)后特征。簽名的性能和泛化性在來(lái)自多個(gè)中心的八個(gè)完全獨(dú)立的數(shù)據(jù)集中得到了驗(yàn)證。高危組患者預(yù)后較差,免疫細(xì)胞浸潤(rùn)較多,免疫相關(guān)功能較活躍,人白細(xì)胞抗原和免疫檢查點(diǎn)分子表達(dá)較高,免疫評(píng)分較高。此外,還基于風(fēng)險(xiǎn)特征分析了抗PDL-1免疫治療預(yù)測(cè)、體細(xì)胞突變、化療反應(yīng)預(yù)測(cè)和潛在藥物預(yù)測(cè)。4個(gè)模型基因在qPCR中的表達(dá)和調(diào)控驗(yàn)證與生物信息學(xué)分析結(jié)果一致。轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析表明,關(guān)鍵模型基因B4GALNT<>可能在轉(zhuǎn)錄后通過(guò)蛋白質(zhì)修飾來(lái)調(diào)節(jié)CRG。
結(jié)論:本研究確定的銅下垂相關(guān)分子亞型和預(yù)后特征可用于預(yù)測(cè)預(yù)后,并有助于PCa的臨床決策。此外,我們?cè)赑Ca中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)潛在的與銅下垂相關(guān)的癌基因B4GALNT4,可作為治療PCa與銅下垂聯(lián)合治療的靶標(biāo)。