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云計算如何與基因檢測成為“黃金搭檔”

文章來源:醫(yī)谷發(fā)布日期:2015-10-21瀏覽次數:7055

         隨著基因產業(yè)的迅速發(fā)展,云計算正在成為基因公司的“寵兒”。越來越多的基因公司開始利用云計算平臺的高吞吐能力降低海量基因、健康數據分析的成本。剛剛結束的國內規(guī)模大的云計算行業(yè)峰會——2015云棲大會,便成為了基因公司爭相展示創(chuàng)新能力的重要舞臺。 
         深圳華大基因、北京聚道科技、一脈基因等多家基因公司都在此次大會上展示了新的產品和技術,隨著下一代基因測序、生物質譜和醫(yī)學成像等醫(yī)學技術的迅猛發(fā)展,大數據浪潮為生物醫(yī)學帶來了前所未有的機遇,將根本性的改變生物醫(yī)學基礎研究和醫(yī)療實踐,但同時生物醫(yī)學領域數據爆炸式的增長也對海量數據的存儲和分析提出新的挑戰(zhàn)。處理這些數據需要大量的計算資源、大規(guī)模的存儲、高效的數據傳輸、安全穩(wěn)定的運算環(huán)境,而云計算的出現則很好地解決了這些問題。 
         近年來,特別是今年以來,阿里云在基因領域頻頻發(fā)力,讓業(yè)界側目。業(yè)內專家介紹,阿里云強大的批量計算能力,為生物和醫(yī)學領域帶來了全新的基因數據分析體驗。用戶不再需要購買硬件,安裝配置軟件和掌握編程知識,可以從繁瑣的IT設施和數據操作中解放開來,只需要專注科學本身。 
         阿里云專家林河山說:“結合阿里云對象存儲,批量計算服務能夠幫助生物信息分析專家在云上快速構建大規(guī)?;蚪M學應用。用戶將更便捷、更簡單、更迅速完成基因大數據計算,大大降低成本。同樣,因為云計算的賦能,研究人員開展大規(guī)模的基因組學研究打開了“方便之門”,這將催生一批影響人類健康相關的變革性成果。” 
         談及云計算給基因領域帶來的變革影響,在此次云棲大會的基因專場分論壇上,聚道科技CEO李廈戎說道:“我們目前面向基因領域能夠提供一套云計算方案,包括傳輸、存儲、計算以及后續(xù)的分析。例如,我們的一個客戶通過在全國范圍內搜集各種各樣的傳染病原數據,判斷某種傳染病原由哪種致病微生物引起。這就需要數據處理能力能支持不同地區(qū)協(xié)同使用,一旦在某個地區(qū)發(fā)現感染人群,通過檢驗、基因測序就知道所感染的微生物種屬。我們提供云端服務,幫助他們快速解讀微生物的基因組信息,迅速采取對應方案,控制措施。在個人健康問題方面,大數據和云計算能有利于基因遺傳性的分析,助力遺傳病研究,預測后代患病幾率,提供生育醫(yī)學建議。” 
         人類的一套基因組包含30億對堿基,能夠編碼功能蛋白的基因數量在3萬左右,但這僅占整個基因組區(qū)域的3%,基因組上超過90%區(qū)域功能人類還是未知的。對于生命的解讀不僅需要生命科學領域的不斷創(chuàng)新,更需要計算領域的支持和參與。一脈基因創(chuàng)始人郝向穩(wěn)表示:“十年前,業(yè)內開始搜集大量的人群數據,探究基因與疾病的關系,一旦了解某種病跟某種基因的關系,就可以從基因水平提高診斷的準確性,做到用藥。此外,基因數據結合心率、血壓、血糖甚至醫(yī)學項目數據,才能正確地評判個體的健康狀況。一脈基因的定位主要是做人的基因組數據分析、存儲、解讀,以及相關健康產品的開發(fā)。我們在做這個事情的過程當中,逐漸認識到利用云計算不僅可以前期減少投資,同時也避免購買服務器所產生的折舊損失。”
未來十年內大數據與人工智能將會改變幾乎每一個行業(yè),尤其是醫(yī)療,云計算與人工智能的結合將對基因數據進行更為深入的挖掘。對此,華大基因互聯(lián)網發(fā)展中心總監(jiān)官鑫做了進一步的解釋:“基因及其研究,本身就與大眾關系密切,而且需要巨大數據量才能解決問題、得到結果。當大數據和人工智能應用到基因行業(yè)時,能讓基因行業(yè)從傳統(tǒng)的實驗科學走上一個快速突破的道路。現在我們對于很多復雜疾病的了解,包括人的表情與基因數據的關系,都需要很多的樣本量去做驗證,甚至需要機器學習完成。如果有這樣的大數據技術和云計算,包括人工智能介入,可以做出很多成果和開發(fā)出很多產品。”
雖然基因測序已經開始影響并滲透我們的生活,但在大眾的印象里,基因測序更多的還是傾向于“高大上”的健康消費,不是一般民眾可以支付,那政府需要做一些什么工作來鼓勵基因行業(yè)企業(yè)走向“大眾化”。
李夏戎認為:政府目前能做的事情,是認真做好數據安全性的標準問題,在這個方面,美國做得比較好,其無論在醫(yī)療數據還是個人有關數據方面,都有一系列的標準保證它如何存儲、傳輸,同時包括正確處理個人隱私方面的問題,而在我國,數據安全性還是一個比較模糊的概念,同時,每個人擁有兩萬多個基因,檢測關注度會不一樣,采用的技術、芯片也各不相同,因此目前基因檢測也呈現良莠不齊的情況,由此導致了行業(yè)的混亂,并終致使基因公司成本比較高,若我國能制定一套系統(tǒng)的數據安全行業(yè)標準,將有效促進企業(yè)成本的降低,從而使得基因測序將會成為大眾的共享。
又快到一年一度全民狂歡的淘寶“雙11”了,前段時間,醫(yī)谷曾報道天貓醫(yī)藥館聯(lián)合聚劃算同全國7大精子庫推出捐精在線預約“聚劃算”,一旦捐精成功,可以獲得3000-5000元的捐精補助,此外還有各大精子庫的的福利套餐,其中包括699元的親子鑒定、199元的酒精代謝基因檢測,如此實惠的基因檢測引來了一大幫男筒子的熱烈響應,華大基因、聚道科技、一脈基因也表示有想法在淘寶天貓進行推廣產品,因為淘寶是非常好的電商推廣渠道,但是不能把它當做的銷售渠道和的目的,且在流程服務方面也要非常謹慎,做到讓基因檢測既普及的同時又普惠了大眾。