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2021 ASH搶先看 | 陸道培醫(yī)院分子醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)學(xué)術(shù)成果驚艷亮相

文章來(lái)源:醫(yī)脈通發(fā)布日期:2022-01-19瀏覽次數(shù):145

第63屆美國(guó)血液學(xué)年會(huì)(ASH)將于2021年12月11日-14日盛大召開(kāi)。作為全球首屈一指的血液學(xué)領(lǐng)域的學(xué)術(shù)交流盛會(huì),ASH擁有來(lái)自近100個(gè)國(guó)家的25000多名會(huì)員,每年都會(huì)分享并探討有關(guān)血液學(xué)的創(chuàng)新理念及新的科學(xué)和臨床研究成果。本次會(huì)議中陸道培醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)以2篇口頭報(bào)告(Oral),9篇墻報(bào)展示(Poster),共11項(xiàng)研究成果驚艷亮相。

作為中國(guó)非公立醫(yī)療機(jī)構(gòu)的佼佼者,陸道培醫(yī)院能將世界前沿的醫(yī)療服務(wù)帶給患者離不開(kāi)其分子醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)的貢獻(xiàn)。分子醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)為陸道培醫(yī)院的臨床治療保駕護(hù)航,提供了的檢測(cè)支持,也獲得了豐富的學(xué)術(shù)成果。值此之際,醫(yī)脈通誠(chéng)摯地邀請(qǐng)陸道培醫(yī)院檢驗(yàn)科專(zhuān)家接受采訪(fǎng),分享其即將在A(yíng)SH會(huì)議上公布的近研究進(jìn)展。

醫(yī)脈通:B細(xì)胞前體急性淋巴細(xì)胞白血病(B-ALL)分子譜的研究對(duì)其診斷和治療意義重大。您認(rèn)為未來(lái)B-ALL疾病領(lǐng)域中還有哪些值得探索的研究方向?

摘要號(hào):1312
基于轉(zhuǎn)錄組分類(lèi)模型和共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析鑒定B-ALL中新的CXCR4alt亞型和Blnk基因剪接變異


曹泮翔(生物信息)研究員

B細(xì)胞前體急性淋巴細(xì)胞白血?。˙-ALL)是一種具有分期特異性表型和細(xì)胞遺傳學(xué)特征的異質(zhì)性急性白血病。盡管對(duì)B-ALL分子譜的研究有助于診斷和風(fēng)險(xiǎn)分層,但是在轉(zhuǎn)錄組層面,白血病發(fā)生發(fā)展的機(jī)制仍然未明,這給疾病的診斷和治療帶來(lái)了挑戰(zhàn)。

1)B-ALL的治療需要對(duì)疾病進(jìn)行分型。經(jīng)過(guò)系統(tǒng)地研究,我們發(fā)現(xiàn)結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),可以地對(duì)B-ALL進(jìn)行分型,尤其是針對(duì)缺乏典型分子細(xì)胞遺傳學(xué)特征的病例,包括Ph-like、ETV6-RUNX1-like和ZNF384-r-like亞型。進(jìn)一步基于基因表達(dá)特征進(jìn)行聚類(lèi),成功分離出以CXCR4改變(CXCR4alt)為特征的候選分子亞型。這種新發(fā)現(xiàn)的CXCR4alt亞型占B-ALL病例的2%,具有以CXCR4 R334X突變及FLNA過(guò)表達(dá),導(dǎo)致CXCL12-CXCR4-MAPK通路活化的獨(dú)特的生物學(xué)特征。

2)盡管B-ALL的分型有助于治療,但仍然有不少分子亞型的病例難治復(fù)發(fā),因而需要對(duì)B-ALL的發(fā)生發(fā)展機(jī)制進(jìn)行深入研究。通過(guò)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)(WGCNA)以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析,深入挖掘B-ALL發(fā)生發(fā)展背后異常的功能模塊和轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),這些功能模塊和網(wǎng)絡(luò)中的核心基因可以作為潛在治療靶標(biāo)。

3)B-ALL中經(jīng)常發(fā)生基因轉(zhuǎn)錄的異常剪接,亟需探索其剪切形式以助力B-ALL靶向治療。我們發(fā)現(xiàn)BLNK基因的剪接變異常見(jiàn)于特定亞型的B-ALL患者,包括BCR-ABL1、ETV6-RUNX1等,而以pre-BCR信號(hào)活化為特征的亞型,如TCF3-PBX1和MEF2D-r,無(wú)BLNK的剪接變異體,提示BLNK基因的剪切形式可以輔助發(fā)現(xiàn)pre-BCR信號(hào)是否激活,進(jìn)而輔助B-ALL靶向治療。

醫(yī)脈通:隨著第二代基因測(cè)序技術(shù)等分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,AML診療取得了巨大的進(jìn)步。能否分享一下您近年來(lái)在A(yíng)ML診療方面的研究成果?

摘要號(hào):2243
AML中DNTT異常表達(dá)、TdT活化促進(jìn)的基因長(zhǎng)度突變、及其與含ATG預(yù)處理方案的移植預(yù)后的相關(guān)性


周曉蘇博士

隨著技術(shù)的進(jìn)步、成本的降低,基因高通量測(cè)序(NGS)即二代測(cè)序越來(lái)越多地應(yīng)用于血液病臨床診斷治療中。相對(duì)于一代測(cè)序,NGS不僅能發(fā)現(xiàn)更多低頻率的突變,而且能同時(shí)檢測(cè)多個(gè)基因,便于更全面地了解腫瘤的分子遺傳學(xué)。

AML是異質(zhì)性非常高的血液腫瘤,分子遺傳學(xué)研究已經(jīng)明確了部分與AML預(yù)后分層有關(guān)的基因,如FLT3-ITD,NPM2,RUNX1,CEBPA雙等位基因等。根據(jù)基因突變類(lèi)型可對(duì)危險(xiǎn)度進(jìn)行分層,但是同一危險(xiǎn)層級(jí)的個(gè)體仍然存在較大生存差異,所以基因突變的分類(lèi)需要更深入細(xì)化的研究。

此次我們?cè)贏(yíng)SH摘要上公布的這項(xiàng)研究就是在NGS的基礎(chǔ)上,探討了AML中DNTT異常表達(dá)、TdT(DNTT編碼)活化的微同源介導(dǎo)的復(fù)制依賴(lài)重組(MMRDR)機(jī)制與基因長(zhǎng)度突變(LM)的關(guān)系,及其與預(yù)后的相關(guān)性。

研究共納入578例AML患者,通過(guò)對(duì)基因LM類(lèi)型的分析,發(fā)現(xiàn)含非模板添加序列的類(lèi)型中,其添加序列具有高GC含量的特點(diǎn),序列長(zhǎng)度與GC含量正相關(guān)。結(jié)合轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq)獲得的基因表達(dá)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)含TdT活化可能參與的基因LM類(lèi)型的患者中異常高表達(dá)DNTT。這些證據(jù)顯示,作為淋系特異表達(dá)的TdT,AML中其異常活化介導(dǎo)的MMRDR機(jī)制在這些患者的基因LM中發(fā)揮作用。在基因LM總體發(fā)病率高的FLT3中,我們也發(fā)現(xiàn)了相同的規(guī)律。含有FLT3 LM-III型(含非模板添加序列)的患者具有顯著的DNTT高表達(dá)。我們對(duì)239例接受含抗胸腺細(xì)胞球蛋白(ATG)預(yù)處理方案的異基因造血干細(xì)胞移植(allo-HSCT)的AML患者進(jìn)行了預(yù)后分析,發(fā)現(xiàn)FLT3 LM-III型突變的患者經(jīng)含ATG預(yù)處理的allo-HSCT預(yù)后更好,提示ATG在部分異常表達(dá)淋系抗原的AML患者中可能同時(shí)有抗腫瘤作用。

由此可見(jiàn),基于NGS的腫瘤基因突變Panel篩查,結(jié)合RNA-seq獲得的基因表達(dá)數(shù)據(jù),有助于提供更多臨床診療和預(yù)后判斷方面的信息。

醫(yī)脈通:全反式維甲酸(ATRA)和砷劑的使用極大地改善了(APL)的預(yù)后,但復(fù)發(fā)仍然存在。在您的研究中,全反式維甲酸和砷治療APL患者的復(fù)發(fā)和耐藥突變情況如何呢?

摘要號(hào):2367
急性早幼粒細(xì)胞白血病患者復(fù)發(fā)和PML-RARA融合基因耐藥突變分析

陳佳琦博士

雖然基于全反式維甲酸(ATRA)、砷劑聯(lián)合化療的方案已經(jīng)使急性早幼粒細(xì)胞白血?。ˋPL)患者獲得了顯著療效和長(zhǎng)期生存,但仍有部分患者出現(xiàn)復(fù)發(fā)或耐藥情況。為此,我們對(duì)APL復(fù)發(fā)、繼發(fā)腫瘤和治療過(guò)程中出現(xiàn)耐藥突變的情況進(jìn)行了研究。

研究回顧性分析了2013年1月至2020年7月間我院收治的40例APL患者的情況。雖然APL患者獲得了高緩解率和長(zhǎng)期生存,但仍有3例患者繼發(fā)腫瘤。而初次發(fā)病的8例和緩解期的1例APL患者均通過(guò)三聯(lián)療法(ATRA、砷劑和化療)獲得持續(xù)緩解且未檢測(cè)到PML-RARA耐藥突變。另有28例APL復(fù)發(fā)后到我院就診,其中9例患者檢測(cè)到PML-RARA耐藥突變。

研究進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)了APL患者規(guī)范治療的重要性:堅(jiān)持系統(tǒng)規(guī)范的治療是獲得快速緩解和減少?gòu)?fù)發(fā)的必要條件。少數(shù)患者在治療中出現(xiàn)耐藥突變導(dǎo)致的疾病進(jìn)展,可見(jiàn)在規(guī)范治療APL的同時(shí),也應(yīng)重視治療本身和患者先天遺傳因素導(dǎo)致的繼發(fā)腫瘤等情況。

醫(yī)脈通:TCF3-HLF陽(yáng)性B-ALL臨床少見(jiàn),預(yù)后極差。能否請(qǐng)您介紹一下您在TCF3-HLF陽(yáng)性B-ALL治療方面取得的進(jìn)展?