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實(shí)用干貨:基因測(cè)序系統(tǒng)工作原理

文章來源:全球醫(yī)療器械網(wǎng)發(fā)布日期:2024-04-10瀏覽次數(shù):35
核心提示:原始測(cè)序數(shù)據(jù)包含了大量的短序列片段,需要經(jīng)過數(shù)據(jù)處理和分析才能得到有意義的信息。

樣本準(zhǔn)備:首先,從生物樣本(如血液、細(xì)胞、組織等)中提?。模危粱颍遥危痢L崛〉模模危粱颍遥危量赡馨繕?biāo)基因或整個(gè)基因組的信息。


文庫(kù)構(gòu)建:提取的DNA或RNA需要經(jīng)過文庫(kù)構(gòu)建步驟,將其轉(zhuǎn)化為適合測(cè)序的文庫(kù)。文庫(kù)構(gòu)建包括DNA片段的斷裂、末端修復(fù)、加頭、連接接頭、PCR擴(kuò)增等步驟。


測(cè)序反應(yīng):文庫(kù)構(gòu)建完成后,將文庫(kù)加載到測(cè)序儀中進(jìn)行測(cè)序反應(yīng)。測(cè)序反應(yīng)根據(jù)不同的測(cè)序技術(shù)(如Sanger測(cè)序、Illumina測(cè)序、PacBio測(cè)序等)而有所不同,但基本原理是通過測(cè)序儀測(cè)量DNA或RNA片段中的堿基序列。


數(shù)據(jù)生成:測(cè)序儀將測(cè)序反應(yīng)的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為原始測(cè)序數(shù)據(jù),通常以FASTQ等格式保存。原始測(cè)序數(shù)據(jù)包含了大量的短序列片段,需要經(jīng)過數(shù)據(jù)處理和分析才能得到有意義的信息。


數(shù)據(jù)分析:原始測(cè)序數(shù)據(jù)經(jīng)過數(shù)據(jù)分析軟件處理,包括序列拼接、堿基識(shí)別、變異檢測(cè)、基因組組裝等步驟。數(shù)據(jù)分析的目的是從海量的測(cè)序數(shù)據(jù)中提取出生物學(xué)信息,如基因型、表達(dá)水平、變異等。


結(jié)果解讀:根據(jù)數(shù)據(jù)分析的結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析和解讀,如確定基因型、比對(duì)到參考基因組、發(fā)現(xiàn)基因變異等。這些結(jié)果可以用于研究基因功能、疾病診斷、個(gè)體基因組學(xué)等領(lǐng)域。